Bonus Charaktere
Folgende Charaktere könnt ihr freispielen.
| Charakter | Vorgabe |
| Hisui | Spielt das Spiel auf Leicht durch |
| Hotsuma | Spielt das Spiel auf Normal durch während ihr einen Shinobi Spielstand auf der Memory Card habt, in dem ihr Shinobi mindestens einmal absolviert habt |
| Joe Musashi | Absolviert 88 Stages im Spiel |